Ученые расшифровали геном лесной земляники

27 декабря 2010, 15:03
Расшифровкой генома маленького растения — лесной земляники (Fragaria vesca) занимался большой международный консорциум, включающий 75 исследователей из 38 научных институтов США, Новой Зеландии, Чили, Норвегии, Испании и Франции. Руководил командой Кевин Фолта (Kevin Folta), доцент Института пищевых и сельскохозяйственных наук Университета Флориды (University of Florida's Institute of Food and Agricultural Sciences). Работа выполнялась как часть проекта BBSRC (Biotechnology and Biological Sciences Research Council), направленного на улучшение селекции культурных растений.

Лесная земляника – восьмое растение, геном которого удалось полностью прочитать. В ядерной ДНК земляники, состоящей из 240 млн. пар оснований, ученые насчитали около 35 тыс. генов. Это больше, чем в геноме человека. Но комплексом неполноценности страдать не стоит – растения, как правило, содержат большее число генов. Для сравнения генетики использовали арабидопсис (Arabidopsis), рис и виноград, геномы которых уже известны. Число генов земляники меньше, чем у риса (57 тысяч), и немногим больше, чем у резуховидки и винограда. У лесной земляники семь пар хромосом. Геном культурной садовой земляники (той, что часто ошибочно называют клубникой) намного сложнее: у нее восемь наборов хромосом, общим числом 56, полученных в ходе селекции от четырех предшественников.

Чтобы прочитать земляничную ДНК, ученые разрезали ее на множество мелких фрагментов, распознали их и затем реконструировали строение целой молекулы. Они впервые поступили так с растительным геномом и убедились, что это возможно. Дело в том, что мелкие фрагменты легче прочитать, но собрать из них «паззл» сложнее, чем из крупных.

Помимо ядерного генома биологи прочитали геном земляничного хлоропласта, содержащий 155691 пар оснований. Его гены кодируют 78 белков.

Для поиска в геноме отдельных генов и их семейств ученые использовали специальную программу (GeneMark.hmm-ES ). С ее помощью они картировали земляничные хромосомы, определив местоположение разных генов. Примерно для двух третей биологи узнали их функции. В первую очередь исследователей интересовали гены полезных для человека качеств, отвечающие за вкус, аромат, пищевую ценность, время цветения и устойчивость к болезням. Разные сорта земляники, например, устойчивые к заболеваниям, есть и сегодня. Но такие сорта, к сожалению, хуже на вкус. Задача будущей селекции – совместить полезные и вкусовые качества в одном растении. Проникновение в геном даст возможность проводить направленную селекцию, отбирая растения для скрещивания не по внешним признакам, а непосредственно по генам.

На пользу родственникам

Земляника относится к большому семейству розоцветных, в которое входят также яблоня, груша, слива, вишня, персик, малина и, естественно, роза. Со своими родственниками по семейству она разделяет 55% генов. Так что прочитав геном земляники генетики получили в руки инструмент для работы и с другими культурными растениями.

Статью с описанием генома лесной земляники дешифровщики опубликовали в журнале Nature Genetics.

Также в разделе:

Огурец в Украине уже стоит в 2,5 раза дороже, чем в прошлом году...

Украина резко увеличила экспорт шампиньонов в 2017 году...

Минфин хочет приравнять ввоз санкционной продукции к уголовно наказуемой контрабанде...

Перспективы развития отечественного АПК члены профильного Комитета Совета Федерации обсудили в Минсельхозе России...

Комментарии (0):

Эту новость еще никто не прокомментировал. Ваш комментарий может стать первым.

Войдите на сайт или зарегистрируйтесь, чтобы комментировать новости.

Также вас может заинтересовать

Нидерланды: Подогрев субстрата повышает урожайность земляники в теплице
21 августа 2017, 00:46
Ученые университета в Вагенингене (Нидерланды) в своих опытных теплицах в Бляйсвике провели исследования о выращивании земляники в теплицах в зимний период. При этом использовался один из ремонтантных сортов селекционной фирмы ABZ Seeds. Рассада была высажена в теплицу в январе 2017 г. В...
Новый сорт неприхотливой земляники
6 мая 2010, 14:45
Новый сорт земляники Seascape быстро созревает и практически не требует ухода, что очень подходит для выращивания в условиях невесомости, например, на Международной космической станции (МКС), считает Кэри Митчелл, профессор университета Purdue, говорится в сообщении на сайте Роскомоса.Землянике...


Авторизуйтесь,
чтобы получить доступ к личному профилю.

Недавние ответы: